MethCNA: a database for integrating genomic and epigenomic data in cancer
 
Home Search Browse Cluster Tutorial Contact  
This file is exist, please try it again!
  DMRs of GSE81224  
 
Chromosome:  
  There are totally 104 DMRs found in chromosome 1.
Note: For small series(<30 samples), M-values are transformed into beta-values.Download table		  
 
Chr Gene Start End Control Avg Tumor Avg Delta Beta Fold P Value UCSC
1 CAPZB 19763994 19765307 0.26539 0.75329 0.4879 2.83843 <0.000001 UCSC
1 HLX 221057478 221057653 0.44465 0.86226 0.41761 1.93919 <0.000001 UCSC
1 HLX 221068565 221068895 0.39052 0.78984 0.39932 2.02256 0.000002 UCSC
1 ELTD1 79472202 79472459 0.28673 0.67235 0.38562 2.34489 <0.000001 UCSC
1 DNM3 172113020 172114905 0.42842 0.81385 0.38543 1.89965 <0.000001 UCSC
1 MIR5087 147782393 147782723 0.17234 0.5509 0.37856 3.1966 0.000001 UCSC
1 HLX 221055639 221055799 0.41181 0.78588 0.37407 1.90837 <0.000001 UCSC
1 ESPN 6515500 6515704 0.21991 0.58992 0.37001 2.68254 0.000011 UCSC
1 LOC728989 146543961 146544127 0.34297 0.70165 0.35868 2.04582 0.000004 UCSC
1 CAPN2 223936719 223936918 0.20782 0.56185 0.35403 2.70353 0.000042 UCSC
1 B3GALT2 193154952 193155646 0.50288 0.85652 0.35364 1.70321 0.000217 UCSC
1 C2CD4D 151810807 151810984 0.19365 0.54645 0.3528 2.82184 0.000101 UCSC
1 TP73 3600249 3601365 0.15673 0.50106 0.34432 3.1969 0.000011 UCSC
1 BARHL2 91184863 91185316 0.23469 0.57786 0.34317 2.46223 0.000017 UCSC
1 HLX 221054124 221054422 0.30661 0.64484 0.33823 2.10311 0.000064 UCSC
1 GALNT2 230271820 230273142 0.54292 0.87627 0.33336 1.61401 <0.000001 UCSC
1 ZBTB40 22611976 22612306 0.45342 0.78102 0.3276 1.72251 <0.000001 UCSC
1 RUNX3 25240379 25241424 0.35693 0.68347 0.32654 1.91485 0.000006 UCSC
1 GSTM5 110254802 110255001 0.35802 0.67246 0.31445 1.8783 0.000004 UCSC
1 BCAN 156616699 156616935 0.31666 0.62835 0.31169 1.98429 0.000271 UCSC
1 ATAD3C 1397747 1398045 0.2834 0.59129 0.30789 2.0864 0.000011 UCSC
1 KCNAB2 6093949 6094461 0.3936 0.69852 0.30492 1.77471 0.000002 UCSC
1 RUNX3 25257537 25257813 0.23484 0.53634 0.30151 2.28391 <0.000001 UCSC
1 LINC00210 218097482 218099533 0.25956 0.56063 0.30107 2.15993 0.000002 UCSC
1 GNG4 235814310 235814368 0.24603 0.5426 0.29657 2.20545 0.000005 UCSC
1 RSG1 16553102 16553432 0.27015 0.56258 0.29243 2.08247 0.000007 UCSC
1 LOC388692 149169033 149171292 0.22884 0.51981 0.29096 2.27145 0.000003 UCSC
1 RPL22 6260282 6260437 0.48428 0.76864 0.28436 1.58719 <0.000001 UCSC
1 BARHL2 91190086 91190531 0.17814 0.46149 0.28336 2.59066 0.000003 UCSC
1 SPSB1 9400436 9401031 0.55376 0.8364 0.28264 1.5104 0.000338 UCSC
1 LOC388692 149155610 149156014 0.19826 0.48068 0.28242 2.42451 0.000029 UCSC
1 PTPRF 44085715 44089801 0.45664 0.73895 0.28231 1.61822 0.000013 UCSC
1 RUNX3 25253939 25254298 0.53607 0.81792 0.28185 1.52576 0.000016 UCSC
1 WARS2 119535899 119536229 0.14699 0.42718 0.28019 2.90614 0.000002 UCSC
1 COL9A2 40769589 40769824 0.56479 0.84486 0.28007 1.49589 0.000002 UCSC
1 NR5A2 199716289 199718404 0.52313 0.80222 0.27908 1.53349 <0.000001 UCSC
1 DDR2 162602277 162602789 0.17635 0.45377 0.27742 2.57311 0.000018 UCSC
1 PRKCZ 2106924 2108155 0.59652 0.87348 0.27696 1.4643 0.000081 UCSC
1 KIAA1522 33230584 33231868 0.56088 0.83765 0.27677 1.49345 <0.000001 UCSC
1 TAL1 47692262 47695484 0.34715 0.62216 0.27501 1.7922 <0.000001 UCSC
1 LHX8 75602766 75603074 0.12076 0.39552 0.27475 3.27516 0.000005 UCSC
1 KIAA1026 15255568 15256708 0.33426 0.60756 0.27329 1.8176 0.001043 UCSC
1 No Gene 244094786 244095018 0.29101 0.55291 0.2619 1.9 0.000019 UCSC
1 CACYBP 174968025 174968208 0.33228 0.58579 0.25351 1.76293 0.000159 UCSC
1 COL11A1 103573733 103574730 0.14884 0.40076 0.25191 2.69247 0.000008 UCSC
1 DMBX1 46957614 46961084 0.2359 0.48744 0.25154 2.06627 0.000003 UCSC
1 FOXD3 63792018 63792404 0.29133 0.53563 0.2443 1.83859 0.005225 UCSC
1 PAX7 19051718 19052690 0.32543 0.56503 0.2396 1.73628 0.000511 UCSC
1 NDUFS2 161167963 161171185 0.43164 0.65946 0.22782 1.5278 0.001946 UCSC
1 KCNAB2 6105373 6106844 0.67881 0.90608 0.22727 1.3348 <0.000001 UCSC
1 SCNM1 151137163 151137487 0.3209 0.5479 0.227 1.7074 0.000288 UCSC
1 LYPLA2 24120260 24124262 0.4507 0.67612 0.22542 1.50017 0.000211 UCSC
1 FLJ42875 2984138 2984355 0.20045 0.42583 0.22538 2.12437 0.000002 UCSC
1 ELAVL4 50513645 50513663 0.069 0.29369 0.22469 4.25635 0.000029 UCSC
1 SSBP3 54723191 54723489 0.71728 0.9416 0.22432 1.31274 0.000005 UCSC
1 LOC728448 40024485 40025718 0.55127 0.77211 0.22084 1.4006 <0.000001 UCSC
1 MORN1 2261353 2263353 0.3719 0.59132 0.21942 1.59001 0.047954 UCSC
1 WNT2B 113051845 113052005 0.25011 0.46653 0.21642 1.86529 0.000397 UCSC
1 C1orf61 156357674 156358070 0.26463 0.47849 0.21386 1.80815 0.000307 UCSC
1 MIR4666A 228657462 228657792 0.18146 0.39108 0.20962 2.15515 0.000001 UCSC
1 LOC100129924 43250526 43250856 0.18348 0.38512 0.20163 2.09894 0.000086 UCSC
1 CCDC17 46089575 46089811 0.5861 0.77794 0.19184 1.32732 0.000007 UCSC
1 BARHL2 91193424 91197239 0.18383 0.36714 0.18331 1.99718 0.000501 UCSC
1 LOC388692 149193025 149195450 0.20319 0.38296 0.17976 1.88469 0.000003 UCSC
1 CTSK 150780302 150784304 0.65919 0.83887 0.17968 1.27258 0.000655 UCSC
1 SHC1 154941630 154945287 0.25728 0.43495 0.17767 1.69056 0.000017 UCSC
1 WARS2 119541994 119543378 0.17074 0.34553 0.1748 2.02379 0.000065 UCSC
1 C1orf61 156389984 156390369 0.14987 0.32447 0.1746 2.16504 0.000027 UCSC
1 PVRL4 161049499 161049735 0.65287 0.82703 0.17416 1.26676 0.000081 UCSC
1 ACOT11 55088618 55089858 0.6193 0.7921 0.17281 1.27904 0.000172 UCSC
1 VWA1 1376837 1378757 0.55081 0.7236 0.17279 1.31371 0.011309 UCSC
1 FAF1 50894450 50897986 0.08545 0.25059 0.16514 2.93262 0.000013 UCSC
1 KIAA1026 15271466 15272594 0.21265 0.37194 0.15929 1.74906 0.000008 UCSC
1 MIR429 1103520 1105278 0.59482 0.75006 0.15524 1.26099 0.000003 UCSC
1 SKI 2222339 2222566 0.06529 0.21077 0.14548 3.22832 0.000997 UCSC
1 SSBP3 54808203 54809175 0.70567 0.85028 0.14461 1.20493 0.000118 UCSC
1 LHX8 75596678 75596838 0.0732 0.21681 0.14361 2.96179 0.000163 UCSC
1 KIAA1026 15127758 15128056 0.74051 0.87389 0.13337 1.18011 0.000023 UCSC
1 VSIG8 159825403 159825777 0.74584 0.87831 0.13246 1.17761 <0.000001 UCSC
1 NPHP4 5955443 5956507 0.801 0.92838 0.12738 1.15903 0.000029 UCSC
1 CASZ1 10709968 10712574 0.6707 0.79355 0.12284 1.18315 0.000832 UCSC
1 ACTA1 229569885 229569903 0.05593 0.17545 0.11952 3.13711 0.000045 UCSC
1 MEF2D 156460048 156460730 0.10927 0.22869 0.11942 2.0929 0.000056 UCSC
1 KCNJ9 160049766 160052988 0.39113 0.50749 0.11635 1.29747 0.001377 UCSC
1 PDE4B 66258017 66258053 0.08656 0.20047 0.11391 2.31597 0.000543 UCSC
1 C4BPB 207262172 207262684 0.70605 0.81445 0.1084 1.15353 0.000601 UCSC
1 UBE4B 10238016 10242772 0.82298 0.92122 0.09824 1.11937 0.000006 UCSC
1 SKI 2227440 2229198 0.81542 0.90399 0.08857 1.10863 0.022806 UCSC
1 SSU72 1477801 1480117 0.83857 0.90608 0.0675 1.0805 0.000033 UCSC
1 LMX1A 165204665 165204876 0.07053 0.13617 0.06563 1.93055 0.000309 UCSC
1 HFM1 91852398 91853575 0.47672 0.53791 0.06118 1.12834 0.013580 UCSC
1 SDHB 17381241 17384711 0.84377 0.80548 -0.03829 0.95462 0.018709 UCSC
1 RYR2 237628476 237629493 0.91937 0.84199 -0.07739 0.91583 0.000527 UCSC
1 TNFRSF9 7998703 8001925 0.80966 0.70352 -0.10614 0.86891 0.001980 UCSC
1 FLJ37453 16163330 16163759 0.87504 0.76187 -0.11317 0.87067 0.001038 UCSC
1 PER3 7842204 7842571 0.81802 0.67446 -0.14356 0.8245 0.000314 UCSC
1 TP73 3619850 3621927 0.79762 0.61854 -0.17908 0.77548 0.000018 UCSC
1 DHDDS 26797393 26797802 0.42123 0.23431 -0.18692 0.55626 0.000060 UCSC
1 PSMB2 36108142 36108297 0.51087 0.30506 -0.2058 0.59715 <0.000001 UCSC
1 PRDM16 3076919 3078892 0.74765 0.53305 -0.2146 0.71296 0.007734 UCSC
1 SFN 27189234 27189362 0.75023 0.52461 -0.22562 0.69927 0.000044 UCSC
1 S100A9 153330143 153330655 0.58304 0.28267 -0.30037 0.48482 <0.000001 UCSC
1 SLC45A1 8271753 8272083 0.62855 0.25428 -0.37427 0.40455 <0.000001 UCSC
1 CAMTA1 7307526 7308852 0.73908 0.33532 -0.40376 0.4537 0.000001 UCSC
 
 
© 2017 Cai Laboratory.  Last updated on 30 December 2017