PITX3

 

Full name: paired like homeodomain 3 Alias Symbol: 
Type: protein-coding gene Cytoband: 10q24.32
Entrez ID: 5309 HGNC ID: HGNC:9006 Ensembl Gene: ENSG00000107859 OMIM ID: 602669
Drug and gene relationship at DGIdb

 

Expression of PITX3:

 

Dataset Gene EntrezID Probe Log2FC Adj.pValue Expression
GSE17351 PITX3 5309 208277_at -0.1645 0.4027
GSE20347 PITX3 5309 208277_at -0.2375 0.0026
GSE23400 PITX3 5309 208277_at -0.2029 0.0000
GSE26886 PITX3 5309 208277_at 0.1730 0.1458
GSE29001 PITX3 5309 208277_at -0.3627 0.0071
GSE38129 PITX3 5309 208277_at -0.2657 0.0006
GSE45670 PITX3 5309 208277_at -0.0463 0.6832
GSE53622 PITX3 5309 76579 0.0010 0.9896
GSE53624 PITX3 5309 76579 0.0983 0.1971
GSE63941 PITX3 5309 208277_at 0.0312 0.8688
GSE77861 PITX3 5309 208277_at -0.2426 0.0487
GSE97050 PITX3 5309 A_33_P3240318 0.0666 0.8270
TCGA PITX3 5309 RNAseq 2.5450 0.0007

Upregulated datasets: 1; Downregulated datasets: 0.  


 

Survival by PITX3 expression:

 

GSE53622GSE53624TCGA

 

Note: Click image to view full size file.  


Copy number change of PITX3:

 

Dataset Gene EntrezID Gain Loss Normal Detail
GSE15526 PITX3 5309 2 9 19
GSE20123 PITX3 5309 2 8 20
GSE43470 PITX3 5309 0 8 35
GSE46452 PITX3 5309 0 11 48
GSE47630 PITX3 5309 2 14 24
GSE54993 PITX3 5309 8 0 62
GSE54994 PITX3 5309 1 12 40
GSE60625 PITX3 5309 0 0 11
GSE74703 PITX3 5309 0 5 31
GSE74704 PITX3 5309 1 4 15
TCGA PITX3 5309 5 29 62

Total number of gains: 21; Total number of losses: 100; Total Number of normals: 367.  


 

Somatic mutations of PITX3:

 

Generating mutation plots.

 

Highly correlated genes for PITX3:

 

Showing top 20/981 corelated genes with mean PCC>0.5.
Gene1 Gene2 Mean PCC Num. Datasets Num. PCC<0 Num. PCC>0.5
PITX3TSSK20.703523606
PITX3DUSP130.70093605
PITX3GSTM50.689209303
PITX3PDE2A0.679905303
PITX3C15orf390.679084303
PITX3MMP250.67594606
PITX3DUX10.673373706
PITX3TMEM59L0.665656808
PITX3ARSF0.664899505
PITX3F110.663329605
PITX3HAAO0.663185807
PITX3GPR37L10.662677606
PITX3RABEP20.658554403
PITX3PLCD10.65776505
PITX3CEACAM30.65535605
PITX3OPRD10.652023706
PITX3NOXO10.650538303
PITX3LDOC10.649911303
PITX3EGLN20.649396303
PITX3PGM50.648894505

For details and further investigation, click here