AASS

 

Full name: aminoadipate-semialdehyde synthase Alias Symbol: LORSDH|LKRSDH
Type: protein-coding gene Cytoband: 7q31.32
Entrez ID: 10157 HGNC ID: HGNC:17366 Ensembl Gene: ENSG00000008311 OMIM ID: 605113
Drug and gene relationship at DGIdb

 

Expression of AASS:

 

Dataset Gene EntrezID Probe Log2FC Adj.pValue Expression
GSE17351 AASS 10157 214829_at -0.6411 0.1827
GSE20347 AASS 10157 214829_at -0.2933 0.1564
GSE23400 AASS 10157 214829_at -0.1298 0.0148
GSE26886 AASS 10157 210852_s_at -0.4079 0.1169
GSE29001 AASS 10157 214829_at -0.9211 0.0106
GSE38129 AASS 10157 214829_at -0.4807 0.0037
GSE45670 AASS 10157 210852_s_at -0.4323 0.1531
GSE53622 AASS 10157 108714 -0.3501 0.0077
GSE53624 AASS 10157 108714 -0.3138 0.0035
GSE63941 AASS 10157 214829_at -1.9655 0.0020
GSE77861 AASS 10157 214829_at -0.4270 0.1107
GSE97050 AASS 10157 A_23_P8754 0.1734 0.3949
SRP007169 AASS 10157 RNAseq 0.8944 0.1579
SRP008496 AASS 10157 RNAseq 0.2316 0.5945
SRP064894 AASS 10157 RNAseq -0.6194 0.0507
SRP133303 AASS 10157 RNAseq -0.1439 0.5912
SRP159526 AASS 10157 RNAseq -0.4143 0.2086
SRP193095 AASS 10157 RNAseq -0.0944 0.6704
SRP219564 AASS 10157 RNAseq -0.8903 0.0397
TCGA AASS 10157 RNAseq -0.3363 0.0048

Upregulated datasets: 0; Downregulated datasets: 1.  


 

Survival by AASS expression:

 

GSE53622GSE53624TCGA

 

Note: Click image to view full size file.  


Copy number change of AASS:

 

Dataset Gene EntrezID Gain Loss Normal Detail
GSE15526 AASS 10157 7 2 21
GSE20123 AASS 10157 8 2 20
GSE43470 AASS 10157 2 4 37
GSE46452 AASS 10157 8 1 50
GSE47630 AASS 10157 7 4 29
GSE54993 AASS 10157 3 5 62
GSE54994 AASS 10157 10 6 37
GSE60625 AASS 10157 0 0 11
GSE74703 AASS 10157 2 4 30
GSE74704 AASS 10157 5 2 13
TCGA AASS 10157 28 20 48

Total number of gains: 80; Total number of losses: 50; Total Number of normals: 358.  


 

Somatic mutations of AASS:

 

Generating mutation plots.

 

Highly correlated genes for AASS:

 

Showing top 20/215 corelated genes with mean PCC>0.5.
Gene1 Gene2 Mean PCC Num. Datasets Num. PCC<0 Num. PCC>0.5
AASSCDC42EP50.735957303
AASSZNF804A0.675205303
AASSZRANB10.651807303
AASSACVR1B0.649238303
AASSCASP90.64887404
AASSFZD40.647136303
AASSNIPSNAP3A0.643294303
AASSZNF8440.643279404
AASSCHRDL20.642744303
AASSEMCN0.640941303
AASSPITX10.639333404
AASSMAP40.637009303
AASSEEA10.63607404
AASSZNF667-AS10.634056303
AASSCNPPD10.631687303
AASSARHGAP310.630107303
AASSMTERF40.62689303
AASSSGMS20.624565404
AASSC4orf330.623001303
AASSPDE2A0.622615303

For details and further investigation, click here