PITX1

 

Full name: paired like homeodomain 1 Alias Symbol: PTX1|POTX
Type: protein-coding gene Cytoband: 5q31.1
Entrez ID: 5307 HGNC ID: HGNC:9004 Ensembl Gene: ENSG00000069011 OMIM ID: 602149
Drug and gene relationship at DGIdb

 

Expression of PITX1:

 

Dataset Gene EntrezID Probe Log2FC Adj.pValue Expression
GSE17351 PITX1 5307 208502_s_at -1.4602 0.1070
GSE20347 PITX1 5307 208502_s_at -2.2903 0.0000
GSE23400 PITX1 5307 208502_s_at -2.2840 0.0000
GSE26886 PITX1 5307 209587_at -3.4347 0.0000
GSE29001 PITX1 5307 209587_at -2.9810 0.0001
GSE38129 PITX1 5307 208502_s_at -1.4452 0.0150
GSE45670 PITX1 5307 208502_s_at -0.8788 0.0205
GSE53622 PITX1 5307 27207 -1.9171 0.0000
GSE53624 PITX1 5307 27207 -2.4101 0.0000
GSE63941 PITX1 5307 208502_s_at -0.7735 0.3983
GSE77861 PITX1 5307 208502_s_at -1.9255 0.0032
GSE97050 PITX1 5307 A_33_P3240333 -0.3718 0.6391
SRP007169 PITX1 5307 RNAseq -4.4083 0.0000
SRP008496 PITX1 5307 RNAseq -4.2912 0.0000
SRP064894 PITX1 5307 RNAseq -2.7663 0.0000
SRP133303 PITX1 5307 RNAseq -2.5340 0.0000
SRP159526 PITX1 5307 RNAseq -2.5219 0.0003
SRP193095 PITX1 5307 RNAseq -2.5175 0.0000
SRP219564 PITX1 5307 RNAseq -3.3846 0.0006
TCGA PITX1 5307 RNAseq 0.2662 0.0608

Upregulated datasets: 0; Downregulated datasets: 15.  


 

Survival by PITX1 expression:

 

GSE53622GSE53624TCGA

 

Note: Click image to view full size file.  


Copy number change of PITX1:

 

Dataset Gene EntrezID Gain Loss Normal Detail
GSE15526 PITX1 5307 3 11 16
GSE20123 PITX1 5307 4 11 15
GSE43470 PITX1 5307 4 6 33
GSE46452 PITX1 5307 0 27 32
GSE47630 PITX1 5307 0 21 19
GSE54993 PITX1 5307 9 1 60
GSE54994 PITX1 5307 3 13 37
GSE60625 PITX1 5307 0 0 11
GSE74703 PITX1 5307 3 4 29
GSE74704 PITX1 5307 3 5 12
TCGA PITX1 5307 3 36 57

Total number of gains: 32; Total number of losses: 135; Total Number of normals: 321.  


 

Somatic mutations of PITX1:

 

Generating mutation plots.

 

Highly correlated genes for PITX1:

 

Showing top 20/1658 corelated genes with mean PCC>0.5.
Gene1 Gene2 Mean PCC Num. Datasets Num. PCC<0 Num. PCC>0.5
PITX1C5orf66-AS10.860979706
PITX1CYSRT10.840839606
PITX1SNORA680.839063404
PITX1PPL0.83152412011
PITX1MGST20.82426510010
PITX1FUT30.81969712012
PITX1HCG220.815399606
PITX1TMEM400.81440211011
PITX1EPS8L20.8142711011
PITX1ACPP0.81341512011
PITX1TTC90.81205111011
PITX1EXPH50.81083911011
PITX1SMAGP0.81050512011
PITX1CSTB0.81026812011
PITX1CXCR20.80968710010
PITX1KIAA1211L0.806957606
PITX1UPK3B0.803413303
PITX1EPHX30.8019611011
PITX1TRIM290.80133311011
PITX1ZNF1850.79873412011

For details and further investigation, click here