EBAG9

 

Full name: estrogen receptor binding site associated antigen 9 Alias Symbol: EB9|RCAS1
Type: protein-coding gene Cytoband: 8q23.2
Entrez ID: 9166 HGNC ID: HGNC:3123 Ensembl Gene: ENSG00000147654 OMIM ID: 605772
Drug and gene relationship at DGIdb

 

Expression of EBAG9:

 

Dataset Gene EntrezID Probe Log2FC Adj.pValue Expression
GSE17351 EBAG9 9166 204274_at 0.1736 0.6829
GSE20347 EBAG9 9166 204274_at 0.4083 0.0082
GSE23400 EBAG9 9166 204274_at 0.5201 0.0000
GSE26886 EBAG9 9166 204274_at 0.8278 0.0005
GSE29001 EBAG9 9166 204274_at 0.4037 0.2304
GSE38129 EBAG9 9166 204274_at 0.2484 0.0329
GSE45670 EBAG9 9166 204274_at 0.1591 0.2680
GSE53622 EBAG9 9166 2102 0.4737 0.0000
GSE53624 EBAG9 9166 2102 0.5165 0.0000
GSE63941 EBAG9 9166 204274_at 1.2911 0.0148
GSE77861 EBAG9 9166 204274_at -0.2187 0.3316
GSE97050 EBAG9 9166 A_24_P98263 0.2663 0.3983
SRP007169 EBAG9 9166 RNAseq -0.0206 0.9565
SRP008496 EBAG9 9166 RNAseq 0.0867 0.7488
SRP064894 EBAG9 9166 RNAseq 0.6770 0.0012
SRP133303 EBAG9 9166 RNAseq 0.3358 0.0516
SRP159526 EBAG9 9166 RNAseq 0.1503 0.5137
SRP193095 EBAG9 9166 RNAseq -0.0427 0.6766
SRP219564 EBAG9 9166 RNAseq 0.4730 0.2333
TCGA EBAG9 9166 RNAseq -0.0353 0.5380

Upregulated datasets: 1; Downregulated datasets: 0.  


 

Survival by EBAG9 expression:

 

GSE53622GSE53624TCGA

 

Note: Click image to view full size file.  


Copy number change of EBAG9:

 

Dataset Gene EntrezID Gain Loss Normal Detail
GSE15526 EBAG9 9166 16 0 14
GSE20123 EBAG9 9166 17 0 13
GSE43470 EBAG9 9166 23 0 20
GSE46452 EBAG9 9166 25 0 34
GSE47630 EBAG9 9166 24 0 16
GSE54993 EBAG9 9166 0 20 50
GSE54994 EBAG9 9166 36 1 16
GSE60625 EBAG9 9166 0 4 7
GSE74703 EBAG9 9166 20 0 16
GSE74704 EBAG9 9166 11 0 9
TCGA EBAG9 9166 60 1 35

Total number of gains: 232; Total number of losses: 26; Total Number of normals: 230.  


 

Somatic mutations of EBAG9:

 

Generating mutation plots.

 

Highly correlated genes for EBAG9:

 

Showing top 20/680 corelated genes with mean PCC>0.5.
Gene1 Gene2 Mean PCC Num. Datasets Num. PCC<0 Num. PCC>0.5
EBAG9PHF200.839868303
EBAG9STYX0.778099303
EBAG9KIAA05860.763721303
EBAG9ZBTB90.763672303
EBAG9SCMH10.761165303
EBAG9SBF20.748928303
EBAG9ROCK10.743064303
EBAG9UBTD20.739505403
EBAG9ZNF7660.738113303
EBAG9C12orf650.737783303
EBAG9NDUFV10.737722303
EBAG9ECSIT0.737668303
EBAG9PET1170.735932403
EBAG9VAPB0.735383303
EBAG9ZNF8270.734929404
EBAG9PPHLN10.727888303
EBAG9AK20.724811303
EBAG9GUSB0.723534303
EBAG9COX150.72042404
EBAG9CSNK2A20.720169404

For details and further investigation, click here