| Full name: small ArfGAP2 | Alias Symbol: | ||
| Type: protein-coding gene | Cytoband: 1p34.2 | ||
| Entrez ID: 64744 | HGNC ID: HGNC:25082 | Ensembl Gene: ENSG00000084070 | OMIM ID: 616916 |
| Drug and gene relationship at DGIdb | |||
Expression of SMAP2:
| Dataset | Gene | EntrezID | Probe | Log2FC | Adj.pValue | Expression |
|---|---|---|---|---|---|---|
| GSE17351 | SMAP2 | 64744 | 225282_at | 0.2595 | 0.8224 | |
| GSE26886 | SMAP2 | 64744 | 225282_at | -0.5819 | 0.0046 | |
| GSE45670 | SMAP2 | 64744 | 225282_at | -0.1709 | 0.4149 | |
| GSE53622 | SMAP2 | 64744 | 18239 | -0.2087 | 0.0049 | |
| GSE53624 | SMAP2 | 64744 | 18239 | -0.0057 | 0.9428 | |
| GSE63941 | SMAP2 | 64744 | 225282_at | 0.0323 | 0.9489 | |
| GSE77861 | SMAP2 | 64744 | 225282_at | -0.0156 | 0.9098 | |
| GSE97050 | SMAP2 | 64744 | A_23_P406330 | 0.3176 | 0.3528 | |
| SRP007169 | SMAP2 | 64744 | RNAseq | -0.1929 | 0.6686 | |
| SRP008496 | SMAP2 | 64744 | RNAseq | -0.4629 | 0.0746 | |
| SRP064894 | SMAP2 | 64744 | RNAseq | 0.3270 | 0.1930 | |
| SRP133303 | SMAP2 | 64744 | RNAseq | -0.0856 | 0.6525 | |
| SRP159526 | SMAP2 | 64744 | RNAseq | -0.2635 | 0.5613 | |
| SRP193095 | SMAP2 | 64744 | RNAseq | 0.1407 | 0.4710 | |
| SRP219564 | SMAP2 | 64744 | RNAseq | 0.8983 | 0.0008 | |
| TCGA | SMAP2 | 64744 | RNAseq | -0.1784 | 0.0042 |
Upregulated datasets: 0; Downregulated datasets: 0.
Survival by SMAP2 expression:
 |  |  |
| GSE53622 | GSE53624 | TCGA |
Note: Click image to view full size file.
Copy number change of SMAP2:
| Dataset | Gene | EntrezID | Gain | Loss | Normal | Detail |
|---|---|---|---|---|---|---|
| GSE15526 | SMAP2 | 64744 | 3 | 4 | 23 | |
| GSE20123 | SMAP2 | 64744 | 2 | 3 | 25 | |
| GSE43470 | SMAP2 | 64744 | 7 | 2 | 34 | |
| GSE46452 | SMAP2 | 64744 | 4 | 1 | 54 | |
| GSE47630 | SMAP2 | 64744 | 9 | 2 | 29 | |
| GSE54993 | SMAP2 | 64744 | 0 | 1 | 69 | |
| GSE54994 | SMAP2 | 64744 | 13 | 2 | 38 | |
| GSE60625 | SMAP2 | 64744 | 0 | 0 | 11 | |
| GSE74703 | SMAP2 | 64744 | 6 | 1 | 29 | |
| GSE74704 | SMAP2 | 64744 | 1 | 0 | 19 | |
| TCGA | SMAP2 | 64744 | 16 | 16 | 64 |
Total number of gains: 61; Total number of losses: 32; Total Number of normals: 395.
Somatic mutations of SMAP2:
Generating mutation plots.
Highly correlated genes for SMAP2:
Showing top 20/245 corelated genes with mean PCC>0.5.
| Gene1 | Gene2 | Mean PCC | Num. Datasets | Num. PCC<0 | Num. PCC>0.5 |
|---|---|---|---|---|---|
| SMAP2 | SNX12 | 0.795053 | 3 | 0 | 3 |
| SMAP2 | GRAPL | 0.780274 | 3 | 0 | 3 |
| SMAP2 | CD53 | 0.779176 | 5 | 0 | 5 |
| SMAP2 | APOBR | 0.753483 | 3 | 0 | 3 |
| SMAP2 | PREX1 | 0.747342 | 4 | 0 | 4 |
| SMAP2 | ATP6V0D1 | 0.744468 | 3 | 0 | 3 |
| SMAP2 | PIM2 | 0.742199 | 4 | 0 | 4 |
| SMAP2 | XBP1 | 0.740364 | 3 | 0 | 3 |
| SMAP2 | PIK3R5 | 0.739566 | 5 | 0 | 5 |
| SMAP2 | C16orf54 | 0.739075 | 5 | 0 | 4 |
| SMAP2 | IER3IP1 | 0.73747 | 3 | 0 | 3 |
| SMAP2 | P2RY13 | 0.734675 | 5 | 0 | 5 |
| SMAP2 | DCTD | 0.733645 | 3 | 0 | 3 |
| SMAP2 | LAP3 | 0.730148 | 3 | 0 | 3 |
| SMAP2 | TMEM50A | 0.723118 | 3 | 0 | 3 |
| SMAP2 | TNFRSF1B | 0.721219 | 6 | 0 | 6 |
| SMAP2 | NFKB1 | 0.717149 | 3 | 0 | 3 |
| SMAP2 | PIP4K2A | 0.714798 | 4 | 0 | 4 |
| SMAP2 | UBE2Z | 0.711865 | 3 | 0 | 3 |
| SMAP2 | SELPLG | 0.710701 | 4 | 0 | 3 |
For details and further investigation, click here
