SELPLG

 

Full name: selectin P ligand Alias Symbol: PSGL-1|CD162
Type: protein-coding gene Cytoband: 12q24.11
Entrez ID: 6404 HGNC ID: HGNC:10722 Ensembl Gene: ENSG00000110876 OMIM ID: 600738
Drug and gene relationship at DGIdb

 

Expression of SELPLG:

 

Dataset Gene EntrezID Probe Log2FC Adj.pValue Expression
GSE17351 SELPLG 6404 209879_at 0.3739 0.6931
GSE20347 SELPLG 6404 209880_s_at -0.1339 0.0463
GSE23400 SELPLG 6404 209879_at 0.0852 0.1409
GSE26886 SELPLG 6404 209879_at 0.1296 0.6753
GSE29001 SELPLG 6404 209879_at 0.0407 0.9032
GSE38129 SELPLG 6404 209880_s_at -0.1563 0.0524
GSE45670 SELPLG 6404 209879_at -0.0144 0.9444
GSE53622 SELPLG 6404 4790 0.1475 0.0480
GSE53624 SELPLG 6404 4790 0.0240 0.8327
GSE63941 SELPLG 6404 209880_s_at 0.6086 0.0002
GSE77861 SELPLG 6404 209880_s_at -0.0753 0.6683
GSE97050 SELPLG 6404 A_23_P64860 0.0399 0.8704
SRP007169 SELPLG 6404 RNAseq 0.8370 0.2523
SRP008496 SELPLG 6404 RNAseq 0.7307 0.1308
SRP064894 SELPLG 6404 RNAseq 0.9662 0.0069
SRP133303 SELPLG 6404 RNAseq 0.1441 0.4207
SRP159526 SELPLG 6404 RNAseq -0.0806 0.9169
SRP193095 SELPLG 6404 RNAseq 0.4104 0.0305
SRP219564 SELPLG 6404 RNAseq 1.2009 0.0035
TCGA SELPLG 6404 RNAseq 0.0898 0.4805

Upregulated datasets: 1; Downregulated datasets: 0.  


 

Survival by SELPLG expression:

 

GSE53622GSE53624TCGA

 

Note: Click image to view full size file.  


Copy number change of SELPLG:

 

Dataset Gene EntrezID Gain Loss Normal Detail
GSE15526 SELPLG 6404 5 3 22
GSE20123 SELPLG 6404 5 4 21
GSE43470 SELPLG 6404 2 1 40
GSE46452 SELPLG 6404 9 1 49
GSE47630 SELPLG 6404 9 1 30
GSE54993 SELPLG 6404 0 5 65
GSE54994 SELPLG 6404 4 2 47
GSE60625 SELPLG 6404 0 0 11
GSE74703 SELPLG 6404 2 0 34
GSE74704 SELPLG 6404 2 2 16
TCGA SELPLG 6404 21 10 65

Total number of gains: 59; Total number of losses: 29; Total Number of normals: 400.  


 

Somatic mutations of SELPLG:

 

Generating mutation plots.

 

Highly correlated genes for SELPLG:

 

Showing top 20/374 corelated genes with mean PCC>0.5.
Gene1 Gene2 Mean PCC Num. Datasets Num. PCC<0 Num. PCC>0.5
SELPLGCOPE0.828159303
SELPLGPREX10.775391505
SELPLGCALY0.766954303
SELPLGFKBP40.762194303
SELPLGSLC32A10.760171303
SELPLGSCAF10.758862303
SELPLGSPEG0.754633303
SELPLGKRTAP12-20.747545303
SELPLGRFXAP0.741226303
SELPLGEPN10.735367505
SELPLGZC3H180.731784404
SELPLGALG110.731454303
SELPLGSLC26A50.72986303
SELPLGOR2AT40.729609303
SELPLGPROP10.7237404
SELPLGSH2B10.723522303
SELPLGKIR3DL20.721495303
SELPLGSLA0.720996505
SELPLGTMCO60.715993303
SELPLGUBA10.713613303

For details and further investigation, click here