ZNF638

 

Full name: zinc finger protein 638 Alias Symbol: NP220|MGC26130|Zfp638
Type: protein-coding gene Cytoband: 2p13.3-p13.2
Entrez ID: 27332 HGNC ID: HGNC:17894 Ensembl Gene: ENSG00000075292 OMIM ID: 614349
Drug and gene relationship at DGIdb
Screen Evidence:

 

Expression of ZNF638:

 

Dataset Gene EntrezID Probe Log2FC Adj.pValue Expression
GSE17351 ZNF638 27332 211257_x_at -0.0488 0.9228
GSE20347 ZNF638 27332 211257_x_at 0.2753 0.0189
GSE23400 ZNF638 27332 211257_x_at 0.2574 0.0000
GSE26886 ZNF638 27332 211257_x_at 0.3396 0.0855
GSE29001 ZNF638 27332 211257_x_at 0.2447 0.5342
GSE38129 ZNF638 27332 211257_x_at 0.2270 0.0135
GSE45670 ZNF638 27332 211257_x_at 0.0246 0.8802
GSE53622 ZNF638 27332 79271 0.2157 0.0038
GSE53624 ZNF638 27332 79271 0.0991 0.4093
GSE63941 ZNF638 27332 211257_x_at -0.5892 0.1217
GSE77861 ZNF638 27332 211257_x_at 0.2172 0.1183
GSE97050 ZNF638 27332 A_24_P3140 -0.1150 0.7423
SRP007169 ZNF638 27332 RNAseq 0.8108 0.0172
SRP008496 ZNF638 27332 RNAseq 0.9393 0.0001
SRP064894 ZNF638 27332 RNAseq 0.0235 0.8830
SRP133303 ZNF638 27332 RNAseq 0.2055 0.0637
SRP159526 ZNF638 27332 RNAseq 0.3378 0.2268
SRP193095 ZNF638 27332 RNAseq 0.0128 0.8747
SRP219564 ZNF638 27332 RNAseq 0.1057 0.7395
TCGA ZNF638 27332 RNAseq -0.0455 0.2950

Upregulated datasets: 0; Downregulated datasets: 0.  


 

Survival by ZNF638 expression:

 

GSE53622GSE53624TCGA

 

Note: Click image to view full size file.  


Copy number change of ZNF638:

 

Dataset Gene EntrezID Gain Loss Normal Detail
GSE15526 ZNF638 27332 11 1 18
GSE20123 ZNF638 27332 11 1 18
GSE43470 ZNF638 27332 3 0 40
GSE46452 ZNF638 27332 2 3 54
GSE47630 ZNF638 27332 7 0 33
GSE54993 ZNF638 27332 0 6 64
GSE54994 ZNF638 27332 11 0 42
GSE60625 ZNF638 27332 0 3 8
GSE74703 ZNF638 27332 3 0 33
GSE74704 ZNF638 27332 9 0 11
TCGA ZNF638 27332 37 2 57

Total number of gains: 94; Total number of losses: 16; Total Number of normals: 378.  


 

Somatic mutations of ZNF638:

 

Generating mutation plots.

 

Highly correlated genes for ZNF638:

 

Showing top 20/524 corelated genes with mean PCC>0.5.
Gene1 Gene2 Mean PCC Num. Datasets Num. PCC<0 Num. PCC>0.5
ZNF638HPS50.817228303
ZNF638ZNF5460.802574303
ZNF638FAM161B0.800845303
ZNF638GCC20.792078303
ZNF638CCNC0.750928303
ZNF638ZNF8780.746977303
ZNF638ARHGEF330.744958303
ZNF638ZNF1210.741255303
ZNF638TOM1L10.734173303
ZNF638C2orf690.733844303
ZNF638ZNF2250.728895403
ZNF638RPF20.728067303
ZNF638LDLRAD30.722706303
ZNF638ZNF7350.714936303
ZNF638DDX590.707039404
ZNF638RBMS10.706151404
ZNF638ZNF2080.699464303
ZNF638OR2AT40.699221303
ZNF638CNOT20.698991404
ZNF638RIOK20.693731303

For details and further investigation, click here