SKAP2

 

Full name: src kinase associated phosphoprotein 2 Alias Symbol: RA70|SKAP-HOM|SKAP55R|SAPS
Type: protein-coding gene Cytoband: 7p15.2
Entrez ID: 8935 HGNC ID: HGNC:15687 Ensembl Gene: ENSG00000005020 OMIM ID: 605215
Drug and gene relationship at DGIdb
Screen Evidence:

 

Expression of SKAP2:

 

Dataset Gene EntrezID Probe Log2FC Adj.pValue Expression
GSE17351 SKAP2 8935 204362_at -0.6158 0.1726
GSE20347 SKAP2 8935 204362_at -0.3252 0.0763
GSE23400 SKAP2 8935 204362_at -0.0575 0.5052
GSE26886 SKAP2 8935 204362_at -0.5042 0.0592
GSE29001 SKAP2 8935 204362_at -0.1852 0.7064
GSE38129 SKAP2 8935 204362_at -0.3242 0.0547
GSE45670 SKAP2 8935 204362_at -0.1908 0.1619
GSE53622 SKAP2 8935 49973 -0.8297 0.0000
GSE53624 SKAP2 8935 49973 -0.6866 0.0000
GSE63941 SKAP2 8935 204362_at -0.9916 0.1478
GSE77861 SKAP2 8935 225639_at -0.8722 0.0274
GSE97050 SKAP2 8935 A_33_P3388312 -1.0370 0.0830
SRP007169 SKAP2 8935 RNAseq -1.0166 0.0020
SRP008496 SKAP2 8935 RNAseq -0.5296 0.0077
SRP064894 SKAP2 8935 RNAseq -0.2614 0.1966
SRP133303 SKAP2 8935 RNAseq 0.0582 0.7627
SRP159526 SKAP2 8935 RNAseq -0.7059 0.0668
SRP193095 SKAP2 8935 RNAseq -0.6233 0.0000
SRP219564 SKAP2 8935 RNAseq -0.5125 0.2813
TCGA SKAP2 8935 RNAseq 0.1052 0.1195

Upregulated datasets: 0; Downregulated datasets: 1.  


 

Survival by SKAP2 expression:

 

GSE53622GSE53624TCGA

 

Note: Click image to view full size file.  


Copy number change of SKAP2:

 

Dataset Gene EntrezID Gain Loss Normal Detail
GSE15526 SKAP2 8935 16 1 13
GSE20123 SKAP2 8935 16 1 13
GSE43470 SKAP2 8935 4 0 39
GSE46452 SKAP2 8935 10 2 47
GSE47630 SKAP2 8935 9 1 30
GSE54993 SKAP2 8935 0 6 64
GSE54994 SKAP2 8935 21 2 30
GSE60625 SKAP2 8935 0 0 11
GSE74703 SKAP2 8935 4 0 32
GSE74704 SKAP2 8935 10 1 9
TCGA SKAP2 8935 54 7 35

Total number of gains: 144; Total number of losses: 21; Total Number of normals: 323.  


 

Somatic mutations of SKAP2:

 

Generating mutation plots.

 

Highly correlated genes for SKAP2:

 

Showing top 20/993 corelated genes with mean PCC>0.5.
Gene1 Gene2 Mean PCC Num. Datasets Num. PCC<0 Num. PCC>0.5
SKAP2PPWD10.799483404
SKAP2PHYHIPL0.799132303
SKAP2KIN0.762431303
SKAP2UBQLN10.741251303
SKAP2TMEM30A0.737087403
SKAP2ZNF33A0.735975303
SKAP2CLEC3B0.732014303
SKAP2THUMPD30.728399303
SKAP2SNN0.728302303
SKAP2HPS50.722198303
SKAP2MTIF30.718546505
SKAP2BDP10.712314404
SKAP2RSRC20.712239403
SKAP2HSPA20.711689403
SKAP2INTS120.710334303
SKAP2RNF1850.70946404
SKAP2GPBP10.704814404
SKAP2AKIRIN10.703026303
SKAP2CRNKL10.699748303
SKAP2SORCS10.699242505

For details and further investigation, click here