EFTUD2

 

Full name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2 Alias Symbol: U5-116KD|Snrp116|Snu114|SNRNP116
Type: protein-coding gene Cytoband: 17q21.31
Entrez ID: 9343 HGNC ID: HGNC:30858 Ensembl Gene: ENSG00000108883 OMIM ID: 603892
Drug and gene relationship at DGIdb

 

Expression of EFTUD2:

 

Dataset Gene EntrezID Probe Log2FC Adj.pValue Expression
GSE17351 EFTUD2 9343 222398_s_at 0.6465 0.0591
GSE26886 EFTUD2 9343 222398_s_at 0.6033 0.0001
GSE45670 EFTUD2 9343 222398_s_at 0.4973 0.0001
GSE53622 EFTUD2 9343 58231 0.5573 0.0000
GSE53624 EFTUD2 9343 58231 0.7746 0.0000
GSE63941 EFTUD2 9343 222398_s_at 1.4091 0.0001
GSE77861 EFTUD2 9343 222398_s_at 0.7387 0.0003
GSE97050 EFTUD2 9343 A_23_P55190 0.8058 0.0781
SRP007169 EFTUD2 9343 RNAseq 0.7847 0.0095
SRP008496 EFTUD2 9343 RNAseq 0.5244 0.0121
SRP064894 EFTUD2 9343 RNAseq 0.8131 0.0000
SRP133303 EFTUD2 9343 RNAseq 0.5774 0.0001
SRP159526 EFTUD2 9343 RNAseq 0.4817 0.0033
SRP193095 EFTUD2 9343 RNAseq 0.4132 0.0000
SRP219564 EFTUD2 9343 RNAseq 0.7117 0.0428
TCGA EFTUD2 9343 RNAseq 0.2409 0.0000

Upregulated datasets: 1; Downregulated datasets: 0.  

 

Survival by EFTUD2 expression:

 

GSE53622GSE53624TCGA

 

Note: Click image to view full size file.  

Copy number change of EFTUD2:

 

Dataset Gene EntrezID Gain Loss Normal Detail
GSE15526 EFTUD2 9343 6 2 22
GSE20123 EFTUD2 9343 6 2 22
GSE43470 EFTUD2 9343 1 2 40
GSE46452 EFTUD2 9343 32 0 27
GSE47630 EFTUD2 9343 9 0 31
GSE54993 EFTUD2 9343 3 4 63
GSE54994 EFTUD2 9343 8 7 38
GSE60625 EFTUD2 9343 4 0 7
GSE74703 EFTUD2 9343 1 1 34
GSE74704 EFTUD2 9343 4 1 15
TCGA EFTUD2 9343 27 6 63

Total number of gains: 101; Total number of losses: 25; Total Number of normals: 362.  

 

Somatic mutations of EFTUD2:

 

Generating mutation plots.

 

Highly correlated genes for EFTUD2:

 

Showing top 20/2208 corelated genes with mean PCC>0.5.
Gene1 Gene2 Mean PCC Num. Datasets Num. PCC<0 Num. PCC>0.5
EFTUD2PDIA40.823693606
EFTUD2RNF130.822737303
EFTUD2RNF1300.820794303
EFTUD2FAM32A0.802144303
EFTUD2CASK0.798062505
EFTUD2ILF20.795646707
EFTUD2ALKBH60.787618404
EFTUD2BIRC50.78498707
EFTUD2SLC38A100.78292404
EFTUD2DHX370.781259606
EFTUD2CDC450.774122707
EFTUD2LRRC590.769831505
EFTUD2USP100.769663707
EFTUD2DTL0.769282808
EFTUD2U2SURP0.766584606
EFTUD2BAG40.762131303
EFTUD2NOP20.759766808
EFTUD2PARVB0.75973404
EFTUD2AATF0.758778808
EFTUD2SENP30.758568706

For details and further investigation, click here