GIMAP2

 

Full name: GTPase, IMAP family member 2 Alias Symbol: DKFZp586D0824|HIMAP2|IMAP2|IAN12
Type: protein-coding gene Cytoband: 7q36.1
Entrez ID: 26157 HGNC ID: HGNC:21789 Ensembl Gene: ENSG00000106560 OMIM ID: 608085
Drug and gene relationship at DGIdb

 

Expression of GIMAP2:

 

Dataset Gene EntrezID Probe Log2FC Adj.pValue Expression
GSE17351 GIMAP2 26157 232024_at -0.0589 0.9766
GSE26886 GIMAP2 26157 232024_at -0.1408 0.8123
GSE45670 GIMAP2 26157 232024_at -0.4610 0.3246
GSE53622 GIMAP2 26157 49010 -0.0506 0.7622
GSE53624 GIMAP2 26157 49010 -0.1872 0.3041
GSE63941 GIMAP2 26157 232024_at -1.3156 0.3237
GSE77861 GIMAP2 26157 232024_at 0.0925 0.5218
GSE97050 GIMAP2 26157 A_23_P368681 0.5918 0.3385
SRP007169 GIMAP2 26157 RNAseq 0.5351 0.4815
SRP008496 GIMAP2 26157 RNAseq 0.1046 0.8272
SRP064894 GIMAP2 26157 RNAseq 0.3525 0.2949
SRP133303 GIMAP2 26157 RNAseq 0.0125 0.9658
SRP159526 GIMAP2 26157 RNAseq 0.3843 0.4522
SRP193095 GIMAP2 26157 RNAseq 0.0032 0.9906
SRP219564 GIMAP2 26157 RNAseq 0.8644 0.0277
TCGA GIMAP2 26157 RNAseq 0.1023 0.5650

Upregulated datasets: 0; Downregulated datasets: 0.  


 

Survival by GIMAP2 expression:

 

GSE53622GSE53624TCGA

 

Note: Click image to view full size file.  


Copy number change of GIMAP2:

 

Dataset Gene EntrezID Gain Loss Normal Detail
GSE15526 GIMAP2 26157 2 4 24
GSE20123 GIMAP2 26157 2 4 24
GSE43470 GIMAP2 26157 2 5 36
GSE46452 GIMAP2 26157 7 2 50
GSE47630 GIMAP2 26157 5 9 26
GSE54993 GIMAP2 26157 3 3 64
GSE54994 GIMAP2 26157 6 8 39
GSE60625 GIMAP2 26157 0 0 11
GSE74703 GIMAP2 26157 2 4 30
GSE74704 GIMAP2 26157 1 4 15
TCGA GIMAP2 26157 25 26 45

Total number of gains: 55; Total number of losses: 69; Total Number of normals: 364.  


 

Somatic mutations of GIMAP2:

 

Generating mutation plots.

 

Highly correlated genes for GIMAP2:

 

Showing top 20/300 corelated genes with mean PCC>0.5.
Gene1 Gene2 Mean PCC Num. Datasets Num. PCC<0 Num. PCC>0.5
GIMAP2MPEG10.769045606
GIMAP2EVI2A0.738179606
GIMAP2MS4A70.732151404
GIMAP2PIK3CG0.731831605
GIMAP2CD480.730064707
GIMAP2CYBB0.726029808
GIMAP2IL2RG0.726023404
GIMAP2IL10RA0.723918707
GIMAP2EVI2B0.72348707
GIMAP2GNGT20.720484303
GIMAP2CD1D0.717138303
GIMAP2DOCK20.715754707
GIMAP2CD3D0.714141707
GIMAP2MS4A6A0.705882706
GIMAP2GIMAP60.70262806
GIMAP2AIF10.697781706
GIMAP2PSMB8-AS10.69764505
GIMAP2CYTIP0.696689706
GIMAP2GIMAP40.695339807
GIMAP2GMFG0.695232706

For details and further investigation, click here