HACE1

 

Full name: HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 Alias Symbol: KIAA1320
Type: protein-coding gene Cytoband: 6q16.3
Entrez ID: 57531 HGNC ID: HGNC:21033 Ensembl Gene: ENSG00000085382 OMIM ID: 610876
Drug and gene relationship at DGIdb

 

Expression of HACE1:

 

Dataset Gene EntrezID Probe Log2FC Adj.pValue Expression
GSE17351 HACE1 57531 227471_at -0.8403 0.0336
GSE26886 HACE1 57531 227471_at -1.4195 0.0001
GSE45670 HACE1 57531 227471_at -0.5624 0.0019
GSE53622 HACE1 57531 19649 -0.7243 0.0000
GSE53624 HACE1 57531 19649 -0.7941 0.0000
GSE63941 HACE1 57531 227471_at -0.8319 0.0431
GSE77861 HACE1 57531 227471_at -0.6316 0.0258
GSE97050 HACE1 57531 A_23_P250002 -0.1836 0.5127
SRP007169 HACE1 57531 RNAseq -0.8531 0.0166
SRP008496 HACE1 57531 RNAseq -1.1403 0.0000
SRP064894 HACE1 57531 RNAseq -0.7271 0.0254
SRP133303 HACE1 57531 RNAseq -0.3620 0.0011
SRP159526 HACE1 57531 RNAseq -0.6815 0.0302
SRP193095 HACE1 57531 RNAseq -0.6403 0.0000
SRP219564 HACE1 57531 RNAseq -0.8839 0.0071
TCGA HACE1 57531 RNAseq -0.1211 0.0497

Upregulated datasets: 0; Downregulated datasets: 2.  


 

Survival by HACE1 expression:

 

GSE53622GSE53624TCGA

 

Note: Click image to view full size file.  


Copy number change of HACE1:

 

Dataset Gene EntrezID Gain Loss Normal Detail
GSE15526 HACE1 57531 2 3 25
GSE20123 HACE1 57531 2 2 26
GSE43470 HACE1 57531 3 1 39
GSE46452 HACE1 57531 2 11 46
GSE47630 HACE1 57531 8 5 27
GSE54993 HACE1 57531 3 2 65
GSE54994 HACE1 57531 8 8 37
GSE60625 HACE1 57531 0 2 9
GSE74703 HACE1 57531 2 1 33
GSE74704 HACE1 57531 1 0 19
TCGA HACE1 57531 6 25 65

Total number of gains: 37; Total number of losses: 60; Total Number of normals: 391.  


 

Somatic mutations of HACE1:

 

Generating mutation plots.

 

Highly correlated genes for HACE1:

 

Showing top 20/516 corelated genes with mean PCC>0.5.
Gene1 Gene2 Mean PCC Num. Datasets Num. PCC<0 Num. PCC>0.5
HACE1SPAG170.73522403
HACE1CAB39L0.732165606
HACE1KIAA02320.727021707
HACE1FAM214A0.718545606
HACE1PARD6B0.712699303
HACE1TVP23B0.709902303
HACE1SHROOM30.707659606
HACE1FLG-AS10.706725606
HACE1SH3BGRL20.704332606
HACE1SASH10.70309707
HACE1CDK190.699153606
HACE1RRAGD0.699131606
HACE1PRSS20.693758404
HACE1SIM20.693209606
HACE1CAPN50.693133606
HACE1GABRP0.690325404
HACE1USO10.68971606
HACE1USP460.684534505
HACE1NUCB20.68415606
HACE1EMP10.675872606

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