| Full name: NEDD1 gamma-tubulin ring complex targeting factor | Alias Symbol: GCP-WD|TUBGCP7 | ||
| Type: protein-coding gene | Cytoband: 12q23.1 | ||
| Entrez ID: 121441 | HGNC ID: HGNC:7723 | Ensembl Gene: ENSG00000139350 | OMIM ID: 600372 |
| Drug and gene relationship at DGIdb | |||
Expression of NEDD1:
| Dataset | Gene | EntrezID | Probe | Log2FC | Adj.pValue | Expression |
|---|---|---|---|---|---|---|
| GSE17351 | NEDD1 | 121441 | 1560116_a_at | 0.6400 | 0.0982 | |
| GSE26886 | NEDD1 | 121441 | 1560116_a_at | 0.4769 | 0.0143 | |
| GSE45670 | NEDD1 | 121441 | 1560116_a_at | 0.3896 | 0.0081 | |
| GSE53622 | NEDD1 | 121441 | 21463 | 0.7759 | 0.0000 | |
| GSE53624 | NEDD1 | 121441 | 21463 | 0.9517 | 0.0000 | |
| GSE63941 | NEDD1 | 121441 | 1560116_a_at | -0.1145 | 0.7919 | |
| GSE77861 | NEDD1 | 121441 | 1560116_a_at | 1.0990 | 0.0009 | |
| GSE97050 | NEDD1 | 121441 | A_33_P3260016 | 0.2383 | 0.3269 | |
| SRP007169 | NEDD1 | 121441 | RNAseq | 1.9784 | 0.0000 | |
| SRP008496 | NEDD1 | 121441 | RNAseq | 2.0457 | 0.0000 | |
| SRP064894 | NEDD1 | 121441 | RNAseq | 0.6317 | 0.0142 | |
| SRP133303 | NEDD1 | 121441 | RNAseq | 1.0479 | 0.0000 | |
| SRP159526 | NEDD1 | 121441 | RNAseq | 1.0393 | 0.0011 | |
| SRP193095 | NEDD1 | 121441 | RNAseq | 0.6461 | 0.0000 | |
| SRP219564 | NEDD1 | 121441 | RNAseq | 0.4622 | 0.2391 | |
| TCGA | NEDD1 | 121441 | RNAseq | 0.3514 | 0.0000 |
Upregulated datasets: 5; Downregulated datasets: 0.
Survival by NEDD1 expression:
 |  |  |
| GSE53622 | GSE53624 | TCGA |
Note: Click image to view full size file.
Copy number change of NEDD1:
| Dataset | Gene | EntrezID | Gain | Loss | Normal | Detail |
|---|---|---|---|---|---|---|
| GSE15526 | NEDD1 | 121441 | 3 | 2 | 25 | |
| GSE20123 | NEDD1 | 121441 | 3 | 2 | 25 | |
| GSE43470 | NEDD1 | 121441 | 3 | 0 | 40 | |
| GSE46452 | NEDD1 | 121441 | 9 | 1 | 49 | |
| GSE47630 | NEDD1 | 121441 | 9 | 1 | 30 | |
| GSE54993 | NEDD1 | 121441 | 0 | 5 | 65 | |
| GSE54994 | NEDD1 | 121441 | 4 | 1 | 48 | |
| GSE60625 | NEDD1 | 121441 | 0 | 0 | 11 | |
| GSE74703 | NEDD1 | 121441 | 3 | 0 | 33 | |
| GSE74704 | NEDD1 | 121441 | 1 | 2 | 17 | |
| TCGA | NEDD1 | 121441 | 16 | 10 | 70 |
Total number of gains: 51; Total number of losses: 24; Total Number of normals: 413.
Somatic mutations of NEDD1:
Generating mutation plots.
Highly correlated genes for NEDD1:
Showing top 20/2152 corelated genes with mean PCC>0.5.
| Gene1 | Gene2 | Mean PCC | Num. Datasets | Num. PCC<0 | Num. PCC>0.5 |
|---|---|---|---|---|---|
| NEDD1 | UBR1 | 0.844345 | 3 | 0 | 3 |
| NEDD1 | NUP107 | 0.810287 | 7 | 0 | 7 |
| NEDD1 | GPR153 | 0.798425 | 4 | 0 | 4 |
| NEDD1 | CMTM4 | 0.79003 | 3 | 0 | 3 |
| NEDD1 | SGTB | 0.786731 | 3 | 0 | 3 |
| NEDD1 | ZNF281 | 0.785503 | 7 | 0 | 7 |
| NEDD1 | MTO1 | 0.777093 | 3 | 0 | 3 |
| NEDD1 | TRMT112 | 0.776854 | 6 | 0 | 6 |
| NEDD1 | RPS21 | 0.775808 | 3 | 0 | 3 |
| NEDD1 | SLC38A6 | 0.775625 | 5 | 0 | 5 |
| NEDD1 | RAB34 | 0.775442 | 3 | 0 | 3 |
| NEDD1 | FADS1 | 0.774395 | 3 | 0 | 3 |
| NEDD1 | PKIG | 0.774198 | 3 | 0 | 3 |
| NEDD1 | PYCR2 | 0.772686 | 3 | 0 | 3 |
| NEDD1 | NUP205 | 0.771903 | 3 | 0 | 3 |
| NEDD1 | TMEM135 | 0.770152 | 4 | 0 | 4 |
| NEDD1 | SPTBN1 | 0.76722 | 3 | 0 | 3 |
| NEDD1 | LPCAT1 | 0.766958 | 7 | 0 | 7 |
| NEDD1 | VPS13C | 0.762882 | 4 | 0 | 3 |
| NEDD1 | EIF1AD | 0.762788 | 3 | 0 | 3 |
For details and further investigation, click here
