APCDD1

 

Full name: APC down-regulated 1 Alias Symbol: B7323
Type: protein-coding gene Cytoband: 18p11.22
Entrez ID: 147495 HGNC ID: HGNC:15718 Ensembl Gene: ENSG00000154856 OMIM ID: 607479
Drug and gene relationship at DGIdb

 

Expression of APCDD1:

 

Dataset Gene EntrezID Probe Log2FC Adj.pValue Expression
GSE17351 APCDD1 147495 225016_at -0.3555 0.7678
GSE26886 APCDD1 147495 225016_at -0.0403 0.9388
GSE45670 APCDD1 147495 225016_at -0.3367 0.2693
GSE53622 APCDD1 147495 123488 -0.5912 0.0000
GSE53624 APCDD1 147495 123488 -0.7796 0.0000
GSE63941 APCDD1 147495 225016_at 2.0881 0.1545
GSE77861 APCDD1 147495 225016_at -0.6634 0.0472
GSE97050 APCDD1 147495 A_23_P337262 -0.5252 0.1810
SRP007169 APCDD1 147495 RNAseq -2.6092 0.0000
SRP008496 APCDD1 147495 RNAseq -1.1805 0.0030
SRP064894 APCDD1 147495 RNAseq -0.6004 0.0756
SRP133303 APCDD1 147495 RNAseq -0.8445 0.0010
SRP159526 APCDD1 147495 RNAseq -1.0423 0.0135
SRP193095 APCDD1 147495 RNAseq -0.1057 0.6947
SRP219564 APCDD1 147495 RNAseq -1.0252 0.1142
TCGA APCDD1 147495 RNAseq 0.0971 0.3760

Upregulated datasets: 0; Downregulated datasets: 3.  


 

Survival by APCDD1 expression:

 

GSE53622GSE53624TCGA

 

Note: Click image to view full size file.  


Copy number change of APCDD1:

 

Dataset Gene EntrezID Gain Loss Normal Detail
GSE15526 APCDD1 147495 6 3 21
GSE20123 APCDD1 147495 6 3 21
GSE43470 APCDD1 147495 1 6 36
GSE46452 APCDD1 147495 3 21 35
GSE47630 APCDD1 147495 7 17 16
GSE54993 APCDD1 147495 6 2 62
GSE54994 APCDD1 147495 8 8 37
GSE60625 APCDD1 147495 0 4 7
GSE74703 APCDD1 147495 1 4 31
GSE74704 APCDD1 147495 4 2 14
TCGA APCDD1 147495 28 24 44

Total number of gains: 70; Total number of losses: 94; Total Number of normals: 324.  


 

Somatic mutations of APCDD1:

 

Generating mutation plots.

 

Highly correlated genes for APCDD1:

 

Showing top 20/38 corelated genes with mean PCC>0.5.
Gene1 Gene2 Mean PCC Num. Datasets Num. PCC<0 Num. PCC>0.5
APCDD1OPN30.634138303
APCDD1PEX60.617795303
APCDD1C10orf990.602439403
APCDD1ATP1B10.59808403
APCDD1SPTLC30.597849504
APCDD1TGM10.58679403
APCDD1SLC7A10.571129504
APCDD1ACADM0.565511403
APCDD1IL20RB0.563175503
APCDD1LYNX10.56122403
APCDD1CRABP20.560932705
APCDD1MFAP30.560729303
APCDD1LINC011590.553608303
APCDD1PAQR50.552464403
APCDD1SMAD60.550154303
APCDD1SFXN30.549093404
APCDD1HES10.547812403
APCDD1CWH430.547471403
APCDD1HSPA20.547124804
APCDD1LPAR60.545141403

For details and further investigation, click here