SUCLG2-AS1

 

Full name: SUCLG2 antisense RNA 1 (head to head) Alias Symbol: 
Type: non-coding RNA Cytoband: 3p14.1
Entrez ID: 101927111 HGNC ID: HGNC:49643 Ensembl Gene: ENSG00000241316 OMIM ID: 

 

Expression of SUCLG2-AS1:

 

Dataset Gene EntrezID Probe Log2FC Adj.pValue Expression
GSE17351 SUCLG2-AS1 101927111 1557338_x_at -0.0412 0.9272
GSE26886 SUCLG2-AS1 101927111 1557338_x_at -0.0764 0.4764
GSE45670 SUCLG2-AS1 101927111 1557338_x_at 0.0156 0.9065
GSE53622 SUCLG2-AS1 101927111 5627 -0.5650 0.0000
GSE53624 SUCLG2-AS1 101927111 5627 -0.4471 0.0000
GSE63941 SUCLG2-AS1 101927111 1557338_x_at 0.1815 0.3234
GSE77861 SUCLG2-AS1 101927111 1557338_x_at 0.0368 0.6998
SRP133303 SUCLG2-AS1 101927111 RNAseq -0.8297 0.0015
SRP159526 SUCLG2-AS1 101927111 RNAseq -0.5427 0.2420
SRP193095 SUCLG2-AS1 101927111 RNAseq -0.4388 0.0302

Upregulated datasets: 0; Downregulated datasets: 0.  


 

Survival by SUCLG2-AS1 expression:

 

GSE53622GSE53624

 

Note: Click image to view full size file.  


Copy number change of SUCLG2-AS1:

 

Dataset Gene EntrezID Gain Loss Normal Detail
GSE15526 SUCLG2-AS1 101927111 1 18 11
GSE20123 SUCLG2-AS1 101927111 1 18 11
GSE43470 SUCLG2-AS1 101927111 0 20 23
GSE46452 SUCLG2-AS1 101927111 2 17 40
GSE47630 SUCLG2-AS1 101927111 1 23 16
GSE54993 SUCLG2-AS1 101927111 5 3 62
GSE54994 SUCLG2-AS1 101927111 1 33 19
GSE60625 SUCLG2-AS1 101927111 3 1 7
GSE74703 SUCLG2-AS1 101927111 0 16 20
GSE74704 SUCLG2-AS1 101927111 1 12 7

Total number of gains: 15; Total number of losses: 161; Total Number of normals: 216.  


 

Somatic mutations of SUCLG2-AS1:

 

Generating mutation plots.

 

Highly correlated genes for SUCLG2-AS1:

 

Showing top 20/57 corelated genes with mean PCC>0.5.
Gene1 Gene2 Mean PCC Num. Datasets Num. PCC<0 Num. PCC>0.5
SUCLG2-AS1PHYH0.738504303
SUCLG2-AS1SPATA40.709698303
SUCLG2-AS1RCAN20.690358303
SUCLG2-AS1ARRB10.649008303
SUCLG2-AS1CKMT20.644552303
SUCLG2-AS1RGS50.630951303
SUCLG2-AS1SGCA0.627407303
SUCLG2-AS1SH3BGR0.626461404
SUCLG2-AS1HSPB60.62043303
SUCLG2-AS1MYOT0.615157303
SUCLG2-AS1LAMB20.607297404
SUCLG2-AS1ILK0.60643303
SUCLG2-AS1CACNA2D20.601522303
SUCLG2-AS1PYGM0.601046303
SUCLG2-AS1CRTAP0.600717303
SUCLG2-AS1SNPH0.600052303
SUCLG2-AS1MRVI10.598811403
SUCLG2-AS1GEM0.597277303
SUCLG2-AS1PI160.597202303
SUCLG2-AS1CDON0.595175303

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