NELL2

 

Full name: neural EGFL like 2 Alias Symbol: NRP2
Type: protein-coding gene Cytoband: 12q12
Entrez ID: 4753 HGNC ID: HGNC:7751 Ensembl Gene: ENSG00000184613 OMIM ID: 602320
Drug and gene relationship at DGIdb

 

Expression of NELL2:

 

Dataset Gene EntrezID Probe Log2FC Adj.pValue Expression
GSE17351 NELL2 4753 203413_at 3.2890 0.0123
GSE20347 NELL2 4753 203413_at 2.0892 0.0000
GSE23400 NELL2 4753 203413_at 1.2544 0.0000
GSE26886 NELL2 4753 203413_at 3.0812 0.0001
GSE29001 NELL2 4753 203413_at 2.6957 0.0003
GSE38129 NELL2 4753 203413_at 2.3055 0.0000
GSE45670 NELL2 4753 203413_at 2.2456 0.0001
GSE53622 NELL2 4753 26715 3.3447 0.0000
GSE53624 NELL2 4753 26715 3.1580 0.0000
GSE63941 NELL2 4753 203413_at 2.1565 0.1179
GSE77861 NELL2 4753 203413_at 2.8385 0.0016
GSE97050 NELL2 4753 A_23_P10025 1.5318 0.1131
SRP007169 NELL2 4753 RNAseq 5.1287 0.0000
SRP008496 NELL2 4753 RNAseq 4.6816 0.0000
SRP064894 NELL2 4753 RNAseq 2.9122 0.0000
SRP133303 NELL2 4753 RNAseq 3.6079 0.0000
SRP159526 NELL2 4753 RNAseq 3.0850 0.0000
SRP193095 NELL2 4753 RNAseq 3.1347 0.0000
SRP219564 NELL2 4753 RNAseq 2.5430 0.0054
TCGA NELL2 4753 RNAseq 0.7741 0.0034

Upregulated datasets: 17; Downregulated datasets: 0.  


 

Survival by NELL2 expression:

 

GSE53622GSE53624TCGA

 

Note: Click image to view full size file.  


Copy number change of NELL2:

 

Dataset Gene EntrezID Gain Loss Normal Detail
GSE15526 NELL2 4753 6 1 23
GSE20123 NELL2 4753 6 1 23
GSE43470 NELL2 4753 3 1 39
GSE46452 NELL2 4753 8 1 50
GSE47630 NELL2 4753 11 2 27
GSE54993 NELL2 4753 0 6 64
GSE54994 NELL2 4753 7 1 45
GSE60625 NELL2 4753 0 0 11
GSE74703 NELL2 4753 3 1 32
GSE74704 NELL2 4753 3 1 16
TCGA NELL2 4753 15 13 68

Total number of gains: 62; Total number of losses: 28; Total Number of normals: 398.  


 

Somatic mutations of NELL2:

 

Generating mutation plots.

 

Highly correlated genes for NELL2:

 

Showing top 20/1531 corelated genes with mean PCC>0.5.
Gene1 Gene2 Mean PCC Num. Datasets Num. PCC<0 Num. PCC>0.5
NELL2CD2760.805883404
NELL2HOXC90.75552404
NELL2CTHRC10.750985707
NELL2LAMC20.74923211011
NELL2XPR10.745695707
NELL2MFAP20.73536311011
NELL2MMP10.72812211011
NELL2CDCA20.726503504
NELL2COL12A10.723991404
NELL2KIF140.71740711011
NELL2WDR660.715885807
NELL2NOP560.711794303
NELL2FSCN10.71002912011
NELL2SPAG50.7082061009
NELL2ACLY0.70817911010
NELL2UHRF10.707986707
NELL2STC20.705786909
NELL2BUB10.704964909
NELL2COL5A20.70249811010
NELL2EME10.701471504

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